水资源 

南溪区境内河流年径流总量3.17亿立方米，水资源总量3.01亿立方米（不包括长江过境水资源量），全区水域面积18.09万亩。 

森林资源 

南溪现有森林面积45万余亩，森林覆盖率46.1%。全省第一个森林康养试点基地在马家7000亩红豆杉森林康养中心挂牌。 

生物资源 

南溪区境内有白鲟、长江鲟、中华鲟、大鲵、胭脂鱼、白鹤、野猪、鸳鸯、戴胜等国家重点保护野生动物40多种；野生植物120科191属309种，有银杏、红豆杉等国家一级保护植物2种，桢楠、润楠、油樟等国家二级保护植物10余种。 

矿产资源 

南溪区现有煤矿采矿权1宗，资源量约329.5万吨；灰岩采矿权 10宗，资源量约1684.14万吨；页岩采矿权11宗，资源量约404.64万吨；砂岩采矿权3宗，资源量约154.03万吨。 

耕地资源 

南溪区现有耕地面积32746.08公顷，耕地保护目标为32233公顷、保护率达98.43%，其中永久基本农田保护目标为25560公顷、保护率高达79.29%。